Corso di Laurea in Biotecnologie

Methods in Computational Biology I

Methods in Computational Biology I

Anno accademico 2022/2023

• METHODS IN COMPUTATIONAL BIOLOGY (BIO0221)

Sommario insegnamento

• Obiettivi formativi
• Risultati dell'apprendimento attesi
• Modalità di insegnamento
• Modalità di verifica dell'apprendimento
• Attività di supporto
• Programma
• Testi consigliati e bibliografia
• Note
• Strumenti didattici

Obiettivi formativi

Il corso si propone di presentare agli studenti una panoramica sugli approcci che sono stati sviluppati nei campi della vita artificiale e dei sistemi complessi. In particolare, il filo conduttore del corso sarà lo studio della network science (reti e alberi) nella modellizzazione di fenomeni biologici, con particolare attenzione alle dinamiche molecolari evolutive e di regolazione genica, al fine di fornire agli studenti una panoramica dei concetti di filogenesi ed evoluzione degli organismi e degli approcci computazionali adatti agli studi di epidemiologia molecolare e della regolazione genica.

Risultati dell'apprendimento attesi

Gli studenti acquisiranno la capacità di leggere criticamente lavori scientifici sulla modellizzazione mediante approcci computazionali di fenomeni biologici, che descrivono e analizzano risultati sperimentali high-throughput relativi alla regolazione ed espressione genica, oltre che inferenze di tipo evolutivo nel campo dell'epidemiologia molecolare 

Modalità di insegnamento

Gli argomenti del corso verranno affrontati attraverso presentazioni dei docenti e la lettura critica di pubblicazioni scientifiche recenti.

Modalità di verifica dell'apprendimento

Colloquio orale che consiste nella presentazione di due articoli della letteratura primaria scelti dallo studente e relativi a due diverse parti del corso.

Attività di supporto

Programma

Regolazione Genica

• I network di regolazione trascrizionale e post-trascrizionale
• Metodi sperimentali high-throughput per lo studio della regolazione genica
• Analisi e interpretazione dei dati sperimentali
• Metodi computazionali per lo studio della regolazione genica
• Network di regolazione genica

Modeling in science and Scientific method

• Scientific method and its evolution
• Experimental design
• Computational modeling in life sciences
• Mathematical models in biotechnology: e.g. ceRNA cross-talk
• Statistical models in epidemiology: e.g. vector borne diseases

Regolazione Genica

• Articoli indicati durante il corso

Orario lezioni

Note

“Le modalità di svolgimento dell'attività didattica potranno subire variazioni in base alle limitazioni imposte dalla crisi sanitaria in corso. In ogni caso è assicurata la modalità a distanza per tutto l'anno accademico”

• Materiale didattico
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