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Methods in Computational Biology I

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Methods in Computational Biology I

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Anno accademico 2023/2024

Codice attività didattica
BIO0221A
Docente
Davide Marnetto (Titolare del corso)
Corso di studio
Laurea Triennale in Biotecnologie
Anno
3° anno
Periodo
Secondo semestre
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
2
SSD attività didattica
BIO/11 - biologia molecolare
Erogazione
Tradizionale
Lingua
Inglese
Frequenza
Obbligatoria
Tipologia esame
Scritto ed orale
Tipologia unità didattica
modulo
Insegnamento integrato
METHODS IN COMPUTATIONAL BIOLOGY (BIO0221)
Prerequisiti
Si prega di consultare il corso integrato.
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

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Risultati dell'apprendimento attesi

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Programma

Methods to analyze genetic variation

  • Introduction to genetic variation: allele and genotype frequency, nucleotide diversity, heterozygosity, Hardy-Weinberg Equilibrium
  • Genetic Drift and its implications: the Wright-Fisher model
  • Population structure: isolation by distance, Fst and Wahlund effect 
  • Visualizing genetic diversity: Principal Component Analysis
  • Recombination, Linkage Disequilibrium and haplotypes
  • computational methods in the analysis of Archaic human genomes
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Modalità di insegnamento

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Modalità di verifica dell'apprendimento

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Attività di supporto

 

 

Testi consigliati e bibliografia



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Orario lezioniV

GiorniOreAula
Martedì13:00 - 16:00
Venerdì15:00 - 18:00

Lezioni: dal 03/03/2017 al 09/06/2017

Nota: Le lezioni inzieranno venerdì 3 marzo 2017 con il segiuente calendario:

- venerdì 3 marzo 2017, Giacobini lezione 1
- venerdì 10 marzo 2017, Giacobini lezione 2
- venerdì 17 marzo 2017, Giacobini lezione 3
- venerdì 24 marzo 2017, Giacobini lezione 4
- venerdì 31 marzo 2017, Giacobini lezione 5
- mercoledì 12 aprile 2017, Bertolotti lezione 1 ***
- martedì 18 aprile 2017, Provero lezione 1
- venerdì 21 aprile 2017, Bertolotti lezione 2
- venerdì 28 aprile 2017, Bertolotti lezione 3
- martedì 2 maggio 2017, Provero lezione 2
- venerdì 5 maggio 2017, Bertolotti lezione 4
- martedì 9 maggio 2017, Provero lezione 3
- venerdì 12 maggio 2017, Provero lezione 4
- martedì 16 maggio 2017, Provero lezione 5
- martedì 23 maggio 2017, Bertolotti lezione 5

- martedì 30 maggio 2017, esonero

Registrazione
  • Aperta
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    Ultimo aggiornamento: 11/05/2023 14:38
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