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Oggetto:
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Methods in Computational Biology I

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Methods in Computational Biology I

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Anno accademico 2021/2022

Codice attività didattica
BIO0221A
Docente
Prof. Paolo Provero (Titolare del corso)
Corso di studio
Laurea Triennale in Biotecnologie
Anno
3° anno
Periodo
Secondo semestre
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
2
SSD attività didattica
BIO/11 - biologia molecolare
Erogazione
Tradizionale
Lingua
Inglese
Frequenza
Facoltativa
Tipologia esame
Scritto ed orale
Tipologia unità didattica
modulo
Corso integrato
METHODS IN COMPUTATIONAL BIOLOGY (BIO0221)
Prerequisiti
Conoscenze di genetica e di biologia molecolare, in particolare dei meccanismi di regolazione genica.
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Sommario del corso

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Obiettivi formativi

Il corso si propone di presentare agli studenti una panoramica sugli approcci che sono stati sviluppati nei campi della vita artificiale e dei sistemi complessi. In particolare, il filo conduttore del corso sarà lo studio della network science (reti e alberi) nella modellizzazione di fenomeni biologici, con particolare attenzione alle dinamiche molecolari evolutive e di regolazione genica, al fine di fornire agli studenti una panoramica dei concetti di filogenesi ed evoluzione degli organismi e degli approcci computazionali adatti agli studi di epidemiologia molecolare e della regolazione genica.

 

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Risultati dell'apprendimento attesi

Gli studenti acquisiranno la capacità di leggere criticamente lavori scientifici sulla modellizzazione mediante approcci computazionali di fenomeni biologici, che descrivono e analizzano risultati sperimentali high-throughput relativi alla regolazione ed espressione genica, oltre che inferenze di tipo evolutivo nel campo dell'epidemiologia molecolare 

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Programma

Regolazione Genica

  • I network di regolazione trascrizionale e post-trascrizionale
  • Metodi sperimentali high-throughput per lo studio della regolazione genica
  • Analisi e interpretazione dei dati sperimentali
  • Metodi computazionali per lo studio della regolazione genica
  • Network di regolazione genica

Modeling in science and Scientific method

  • Scientific method and its evolution
  • Experimental design
  • Computational modeling in life sciences
  • Mathematical models in biotechnology: e.g. ceRNA cross-talk
  • Statistical models in epidemiology: e.g. vector borne diseases
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Modalità di insegnamento

Gli argomenti del corso verranno affrontati attraverso presentazioni dei docenti e la lettura critica di pubblicazioni scientifiche recenti.

 

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Modalità di verifica dell'apprendimento

Colloquio orale che consiste nella presentazione di due articoli della letteratura primaria scelti dallo studente e relativi a due diverse parti del corso.

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Attività di supporto

 

 

Testi consigliati e bibliografia

Oggetto:

Regolazione Genica

  • Articoli indicati durante il corso


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Note

“Le modalità di svolgimento dell'attività didattica potranno subire variazioni in base alle limitazioni imposte dalla crisi sanitaria in corso. In ogni caso è assicurata la modalità a distanza per tutto l'anno accademico”

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Orario lezioniV

GiorniOreAula
Martedì13:00 - 16:00
Venerdì15:00 - 18:00

Lezioni: dal 03/03/2017 al 09/06/2017

Nota: Le lezioni inzieranno venerdì 3 marzo 2017 con il segiuente calendario:

- venerdì 3 marzo 2017, Giacobini lezione 1
- venerdì 10 marzo 2017, Giacobini lezione 2
- venerdì 17 marzo 2017, Giacobini lezione 3
- venerdì 24 marzo 2017, Giacobini lezione 4
- venerdì 31 marzo 2017, Giacobini lezione 5
- mercoledì 12 aprile 2017, Bertolotti lezione 1 ***
- martedì 18 aprile 2017, Provero lezione 1
- venerdì 21 aprile 2017, Bertolotti lezione 2
- venerdì 28 aprile 2017, Bertolotti lezione 3
- martedì 2 maggio 2017, Provero lezione 2
- venerdì 5 maggio 2017, Bertolotti lezione 4
- martedì 9 maggio 2017, Provero lezione 3
- venerdì 12 maggio 2017, Provero lezione 4
- martedì 16 maggio 2017, Provero lezione 5
- martedì 23 maggio 2017, Bertolotti lezione 5

- martedì 30 maggio 2017, esonero

Registrazione
  • Aperta
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    Ultimo aggiornamento: 10/09/2021 16:27
    Location: https://biotec.campusnet.unito.it/robots.html
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