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Methods in Computational Biology I

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Methods in Computational Biology I

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Anno accademico 2023/2024

Codice dell'attività didattica
BIO0221A
Docente
Davide Marnetto (Titolare del corso)
Insegnamento integrato
Corso di studi
Laurea Triennale in Biotecnologie
Anno
3° anno
Periodo didattico
Secondo semestre
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
2
SSD dell'attività didattica
BIO/11 - biologia molecolare
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Inglese
Modalità di frequenza
Obbligatoria
Tipologia d'esame
Scritto ed orale
Prerequisiti
Si prega di consultare il corso integrato.
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

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Risultati dell'apprendimento attesi

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Modalità di insegnamento

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Modalità di verifica dell'apprendimento

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Attività di supporto

 

 

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Programma

Methods to analyze genetic variation

  • Introduction to genetic variation: allele and genotype frequency, nucleotide diversity, heterozygosity, Hardy-Weinberg Equilibrium
  • Genetic Drift and its implications: the Wright-Fisher model
  • Population structure: isolation by distance, Fst and Wahlund effect 
  • Visualizing genetic diversity: Principal Component Analysis
  • Recombination, Linkage Disequilibrium and haplotypes
  • computational methods in the analysis of Archaic human genomes

Testi consigliati e bibliografia



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Orario lezioni

GiorniOreAula
Martedì13:00 - 16:00
Venerdì15:00 - 18:00

Lezioni: dal 03/03/2017 al 09/06/2017

Nota: Le lezioni inzieranno venerdì 3 marzo 2017 con il segiuente calendario:

- venerdì 3 marzo 2017, Giacobini lezione 1
- venerdì 10 marzo 2017, Giacobini lezione 2
- venerdì 17 marzo 2017, Giacobini lezione 3
- venerdì 24 marzo 2017, Giacobini lezione 4
- venerdì 31 marzo 2017, Giacobini lezione 5
- mercoledì 12 aprile 2017, Bertolotti lezione 1 ***
- martedì 18 aprile 2017, Provero lezione 1
- venerdì 21 aprile 2017, Bertolotti lezione 2
- venerdì 28 aprile 2017, Bertolotti lezione 3
- martedì 2 maggio 2017, Provero lezione 2
- venerdì 5 maggio 2017, Bertolotti lezione 4
- martedì 9 maggio 2017, Provero lezione 3
- venerdì 12 maggio 2017, Provero lezione 4
- martedì 16 maggio 2017, Provero lezione 5
- martedì 23 maggio 2017, Bertolotti lezione 5

- martedì 30 maggio 2017, esonero

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Ultimo aggiornamento: 11/05/2023 14:38
Location: https://biotec.campusnet.unito.it/robots.html
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