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Oggetto:
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Biochemical, molecular and cellular technologies B

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Biochemical, molecular and cellular technologies B

Oggetto:

Anno accademico 2022/2023

Codice attività didattica
BIO0201B
Docente
Ymera Pignochino (Titolare del corso)
Corso di studio
Laurea Triennale in Biotecnologie
Anno
3° anno
Periodo
Primo semestre
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
3
SSD attività didattica
BIO/11 - biologia molecolare
Erogazione
Mista
Lingua
Inglese
Frequenza
Facoltativa
Tipologia esame
Scritto ed orale
Tipologia unità didattica
modulo
Insegnamento integrato
BIOCHEMICAL, MOLECULAR AND CELLULAR TECHNOLOGIES (BIO0201)
Prerequisiti
Biochimica, Biologia Molecolare e Genetica di base.
Oggetto:

Sommario insegnamento

Oggetto:

Obiettivi formativi

L'insegnamento di "Biochemical, molecular and cellular technologies B"- modulo di biologia molecolare- concorre alla realizzazione degli obiettivi formativi del CdS in Biotecnologie promuovendo la comprensione e l'acquisizione delle nozioni di base per la scelta dei metodi principali da utilizzare per l'impostazione di un esperimento di biologia molecolare che preveda il sequenziamento degli acidi nucleici, la validazione dei geni candidati e lo studio del loro ruolo funzionale.

The course "Biochemical, molecular and cellular technologies B"-Molecular Biology Module-contributes to the realization of the learning objectives of the course of study in Biotechnologies promoting the comprehension and the acquisition of the basic notions for the choice of the up-to-date methods and technologies for the development of an experimental plan in molecular biology focusing on nucleic acid sequencing, the validation of candidate genes, and the study of their functional role. 

 

Oggetto:

Risultati dell'apprendimento attesi

Modulo di Biologia Molecolare:

Al termine del modulo di biologia molecolare, gli studenti dovranno essere in grado di comprendere, conoscere, saper valutare e scegliere le principali metodologie di biologia molecolare per la pianificazione di un disegno sperimentale  ed essere consapevoli delle loro  possibili limitazioni.

abilità acquisita: pianificazione di un disegno sperimentale per la ricerca e lo studio di geni candidati/ biomarcatori molecolari

competenze trasversali: autonomia di giudizio, capacità di comunicazione, orientamento al risultato, senso economico, lavoro di squadra

Molecular Biology Module:

At the end of the molecular biology module, the students should be able to understand, know, evaluate and choose the main molecular biology techniques for the planning of an experimental design and to be aware of their potential limitations

acquired skills: drawing of an experimental plan for the research and the study of candidate genes/ molecular biomarkers

Soft skills: autonomous independent judgment, communication skills, result orientation, budget calculation, team-working

 

Oggetto:

Programma

MODULO BIOLOGIA MOLECOLARE (Prof. Ymera Pignochino)

1. Sanger Sequencing e analisi STR

2.Next generation sequencing - principi di base e potenziali applicazioni nel campo della biologia molecolare. ATAC-Seq, CLIP-Seq, CHIP-Seq.

3. qPCR e "droplet digital PCR"- validazione di geni candidati e biomarcatori molecolari

4. RNA pull down, EMSA e  tecniche di immunoprecipitazione per lo studio dei meccanismi molecolari, interazioni e ruolo funzionale dei geni candidati.

Il corso coprirà i principali aspetti teorici e sperimentali del sequenziamento del DNA e del RNA, delle tecnologie di validazione dei geni candidati emersi e alcuni esempi di metodologie ("RNA pull-down", EMSA e tecniche di immunoprecipitazione) per lo studio del loro ruolo funzionale come base per la pianificazione di un disegno sperimentale in biologia molecolare 

Esempi di applicazioni delle suddette tecnologie, esercitazioni teorico-pratiche di pianificazione sperimentale

Modulo di Biologia Molecolare:

lezioni teoriche: 16 ore, esercitazioni pratiche: 8 ore

Molecular Biology Module

1. Sanger Sequenicng and STR analysis

2.Next-generation sequencing - basic principles and potential applications in the molecular biology field. ATAC-Seq, CLIP-Seq, CHIP-Seq.

3. qPCR and "droplet digital PCR"- validation of candidate genes and molecular biomarkers 

4. RNA pull-down, EMSA, and immunoprecipitation assays for the study of molecular mechanisms, interactions, and functional roles of candidate genes.

The module focuses on the main theoretical and experimental aspects of DNA/RNA sequencing,  techniques for the validation of candidate genes, and some methodologies (RNA pull-down, EMSA, and immunoprecipitation assays) for the study of their functional roles as a platform for a molecular biology experimental design.

Examples of applications of the presented technologies and practical exercises of experimental planning

Molecular Biology Module: theoretical lessons: 16 hours, laboratory and practical exercises: 8 hours

Oggetto:

Modalità di insegnamento

Lezioni frontali ed esercitazioni in presenza/ telematiche in modalita' sincrona (webex)

 

N.B. To access lessons and other materials you must register to the Moodle of the course:

https://biotec.i-learn.unito.it/course/view.php?id=405

Oggetto:

Modalità di verifica dell'apprendimento

Test scritto (domande chiuse o semistrutturate) per la valutazione della comprensione e dell'acquisizione degli argomenti di basi trattati a lezione e orale: preparazione ed esposizione di esercitazione pratica a gruppi (2-3 studenti/gruppo) per la valutazione dell'abilità di elaborazione di un proprio piano sperimentale sulla base degli argomenti trattati a lezione e degli approfondimenti individuali mediante ricerca bibliografica guidata (riviste scientifiche e siti web)


Written (Open and closed questions)  test for the evaluation of the  comprehension and acquisition of the basic notions as presented during lessons and oral test- preparation and exposition of the practical exercise in groups (2-3 students/groups) for the evaluation of  the acquisition of the ability to draw an experimental design on the basis of the arguments explained during lessons and the individual study by means of guided bibliographic research ( scientific journals and web sites) 

Oggetto:

Attività di supporto

Laboratorio di Biologia Molecolare ed esercitazioni teorico-pratiche sulla piataforma moodle per il modulo di Biologia Molecolare

Practical laboratory and exercises on moodle platform  for the Molecular Biology module

Testi consigliati e bibliografia



Oggetto:
Libro
Titolo:  
Tecniche e metodi per la biologia molecolare
Anno pubblicazione:  
2020
Editore:  
CEA casa editrice ambrosiana
Autore:  
Amaldi, Benedetti, Pesole, Plevani
ISBN  
Capitoli:  
-
Note testo:  
-
Obbligatorio:  
No


Oggetto:
Libro
Titolo:  
Biologia molecolare del gene
Anno pubblicazione:  
2022
Editore:  
zanichelli
Autore:  
James D Watson , Tania A Baker, Stephen P Bell, Alexander Gann ,Michael Levine, Richard Losick
Obbligatorio:  
No


Oggetto:
Libro
Titolo:  
Fondamenti di biologia molecolare
Anno pubblicazione:  
2008
Editore:  
zanichelli
Autore:  
Lizabeth A. Allison
ISBN  
Obbligatorio:  
No
Oggetto:

articoli scientifici consegnati e discussi durante le lezioni

 



Oggetto:

Note

“Le modalità di svolgimento dell'attività didattica potranno subire variazioni in base alle limitazioni imposte dalla crisi sanitaria in corso. In ogni caso è assicurata la modalità a distanza per tutto l'anno accademico”

Oggetto:

Orario lezioniV

GiorniOreAula
Giovedì11:00 - 13:00
Venerdì14:00 - 17:00

Lezioni: dal 15/10/2020 al 15/01/2021

Nota: Inizio lezioni Giovedi 15 Ottobre
I link per le webex saranno disponibili sul moodle del corso:
https://biotec.i-learn.unito.it/course/view.php?id=127
Prima lezione:
150/10/2020 ore 14

Meeting link:
https://unito.webex.com/unito-en/j.php?MTID=m22ef793406e0f5f8379244762f2edf8b
Meeting number:
121 625 6158
Password:
m86pGkw5UkN

Registrazione
  • Chiusa
    Apertura registrazione
    20/09/2022 alle ore 00:00
    Chiusura registrazione
    30/11/2022 alle ore 23:55
    Oggetto:
    Ultimo aggiornamento: 20/07/2022 21:48
    Non cliccare qui!