Corso di Laurea in Biotecnologie

Modulo di Biologia Molecolare:

Lo scopo del presente modulo e' dare allo studente la conoscenza teorica e pratica delle metodologie di sequenziamento di DNA/RNA e dell'analisi dei dati generati con le suddette tecnologie

Molecular Biology Module:

The purpose of the Molecular Biology Module is to give students the theoretical and practical knowledge of the most important methods in DNA/RNA sequencing and bioinformatics data analysis

Modulo di Biologia Molecolare:

Lo studente deve essere capace di destreggiarsi tra le varie metodiche ed essere consapevole delle loro limitazioni

Molecular Biology Module:

The student should be able to navigate through procedures (and be aware of the limitations of them)

Test scritto
domande chiuse o semistrutturate

Laboratorio di Biologia Molecolare e data analysis per il modulo di Biologia Molecolare: 16 hours

Practical laboratory and data analysis for the Molecular Biology module: 16 hours

PROGRAMMA MODULO BIOLOGIA MOLECOLARE (Prof. Calogero)

Tecnologie di sequenziamento di seconda generazione.

Il modulo si focalizza sulla comprensione delle tecnologie di sequenziamento di seconda generazione.

Il corso coprirà gli aspetti sperimentali e computazionali del sequenziamento del DNA e del RNA.

Introduzione sulle tecnologie di sequenziamento:

• Illumina (HISeq, MiSeq), Roche (454), Life Technologies (Ion Torrent).

Preparazione dei campioni:

• miRNA-seq
• mRNA seq
• whole transcriptome sequencing
• directional sequencing
• enrichment protocols
• DNA exome
• DNA whole genome

Analisi dei dati

• Mapping
• Filtering
• Differential expression
• SNP calls

Esempi di applicazioni delle suddette tecnologie