- Oggetto:
- Oggetto:
INTEGRATED LABORATORY TECNIQUES
- Oggetto:
INTEGRATED LABORATORY TECNIQUES
- Oggetto:
Anno accademico 2025/2026
- Codice attività didattica
- BIO0174
- Docenti
- Giulia Caron (Titolare del corso)
Paolo Ettore Porporato (Titolare del corso)
Paola Defilippi (Titolare del corso)
Ferdinando Di Cunto (Titolare del corso)
Chiara Ambrogio (Titolare del corso)
Giuseppe Ermondi (Titolare del corso)
Deborah Chiabrando (Titolare del corso)
Miriam Martini (Titolare del corso) - Corso di studio
- [056701] Biotecnologie
- Anno
- 3° anno
- Periodo
- Primo semestre
- Tipologia
- Caratterizzante
- Crediti/Valenza
- 14
- SSD attività didattica
- BIO/11 - biologia molecolare
BIO/13 - biologia applicata
CHIM/08 - chimica farmaceutica - Erogazione
- Mista
- Lingua
- Inglese
- Frequenza
- Obbligatoria
- Tipologia esame
- Orale
- Prerequisiti
-
La comprensione dei contenuti del modulo richiede di aver acquisito solide basi relativamente a tutti gli insegnamenti previsti per i primi due anni del Corso di Studi, in particolare l’insegnamento di Biologia Molecolare e Bioinformatica. Specificamente, è richiesta una buona comprensione delle seguenti metodiche:
- Ibridazione degli acidi nucleici
- Polymerase Chain Reaction
- Analisi del DNA mediante Southern blot
- Sequenziamento del DNA con metodo di Sanger
- Clonaggio dei geni in vettori plasmidici
- Costruzione di vettori di espressione procariotici ed eucariotici
- Costruzione di library in vettori di espressione
- Metodi per la ricostruzione di geni e trascritti completi.
- Northern e Western blotting
- Reverse-transcription-(RT)-PCR
- Real time PCR
- Ibridizzazione in situ
- Microarrays
- RNA sequencing
- Saggi reporter
- Analisi dei promotori per delezione
- Saggio EMSA
- Saggio di immunoprecipitazione della cromatina (ChIP)
To understand the contents of the teaching, students will need to have acquired a solid basis of all the subjects that characterize the first two years of the Course of Studies, in particular Molecular Biology and Bioinformatics. Specifically, a good understanding of the following methods is required:
- Nucleic acid hybridization
- Polymerase Chain Reaction
- DNA analysis by Southern blot
- DNA sequencing by Sanger method
- Gene cloning in plasmid vectors
- Construction of prokaryotic and eukaryotic expression vectors
- Construction of expression vector libraries
- Methods for reconstructing genes and complete transcripts
- Northern and Western blotting
- Reverse transcription (RT)-PCR
- Real-time PCR
- In situ hybridization
- Microarrays
- RNA sequencing
- Reporter assays
- Promoter deletion analysis
- EMSA assay
- Chromatin immunoprecipitation assay (ChIP)
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Lo scopo dell'insegnamento sarà di fornire un'ampia a aggiornata panoramica delle più importanti metodiche sperimentali utilizzate nell'ambito della ricerca biotecnologica di base e applicata. In particolare, il primo modulo (Basic methods in drug discovery) fornirà le basi teoriche per la comprensione delle tecnologie spettroscopiche (come ad es. la fluorescenza) e delle loro applicazioni biologiche; inoltre questo modulo fornirà nozioni teorico pratiche per lo studio delle proteine mediante modellizzazione per omologia. Il Secondo modulo (Molecular Biology) fornirà le nozioni teorico/pratiche necessarie alla comprensione delle moderne tecnologie di sequenziamento degli acidi nucleici, delle loro applicazioni genomiche, trascrittomiche ed epigenomiche e della loro integrazione con altre metodiche. Verranno fornite inoltre nozioni avanzate sulle tecnologie più moderne per l’ingegnerizzazione degli acidi nucleici, con particolare riguardo a quelle necessarie per lo sviluppo di complessi modelli cellulari e animali. Il terzo modulo (Cellular Biology) fornirà le nozioni necessarie alla comprensione delle tecnologie cellulari e biochimiche e microscopiche correntemente utilizzate per lo studio della funzione genica e dei principali processi biologici. Un aspetto fondamentale dell'insegnamento sarà di mettere in evidenza come le diverse tecnologie affrontate possono essere integrate per rispondere a complessi quesiti biologici. A questo scopo verranno analizzati diversi casi di studio tratti dalla letteratura scientifica recente.
The aim of the course will be to provide a broad and up-to-date overview of the most important experimental methods used in the field of basic and applied biotechnological research. In particular, the first module (Basic methods in Drug Discovery) will provide the theoretical basis for understanding spectroscopic technologies (such as fluorescence) and their biological applications; moreover, this module will provide theoretical and practical notions for the study of proteins by homology modeling. The second module (Molecular Biology) will provide the theoretical / practical notions necessary for the understanding of modern nucleic acid sequencing technologies, their genomic, transcriptomic and epigenomic applications and their integration with other methods. Advanced knowledge will also be provided on the most modern technologies for the engineering of nucleic acids, with particular regard to those necessary for the development of complex cellular and animal models. The third module (Cellular Biology) will provide the notions necessary for understanding the cellular, biochemical and microscopic technologies currently used for the study of gene function and the main biological processes. A fundamental aspect of the teaching will be to highlight how the different technologies addressed can be integrated to answer complex biological questions. To this end, several case studies taken from the recent scientific literature will be analysed.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Al termine dell'insegnamento, gli studenti dovranno dimostrare di:
-
Conoscenza e capacità di comprensione (Knowledge and Understanding)
-
Aver acquisito un’approfondita conoscenza delle basi teoriche su cui si fondano le metodiche sperimentali analizzate durante le lezioni frontali e le esercitazioni.
-
-
Capacità di applicare conoscenza e comprensione (Applying Knowledge and Understanding)
-
Saper scegliere in modo appropriato le tecnologie necessarie alla soluzione di specifici quesiti biologici.
-
-
Autonomia di giudizio (Making Judgements)
-
Essere in grado di integrare correttamente le diverse metodologie sperimentali per analizzare e interpretare dati biologici complessi.
-
-
Abilità comunicative (Communication Skills)
-
Saper comunicare in modo chiaro e rigoroso i concetti e i risultati appresi, utilizzando il linguaggio tecnico appropriato.
-
-
Capacità di apprendimento (Learning Skills)
-
Dimostrare un’autonomia nell’approfondire le tematiche trattate e nell’aggiornarsi sulle metodologie emergenti nel campo della biologia cellulare.
-
By the end of the course, students should be able to:
-
Knowledge and Understanding
-
Demonstrate an in-depth understanding of the theoretical foundations underlying the experimental methodologies analyzed during lectures and practical sessions.
-
-
Applying Knowledge and Understanding
-
Select appropriate technologies to address specific biological questions.
-
-
Making Judgements
-
Integrate different experimental methodologies to analyze and interpret complex biological data.
-
-
Communication Skills
-
Communicate concepts and findings clearly and rigorously, using appropriate technical language.
-
-
Learning Skills
-
Demonstrate autonomy in further exploring the topics covered and keeping up to date with emerging methodologies in cellular biology.
-
-
- Oggetto:
Programma
Il programma dettagliato è riportato nella corrispondente sezione dei diversi moduli.
The detailed program is reported in the corresponding section of the different modules.
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
La maggior parte delle lezioni verranno svolte in forma frontale in presenza. Nei moduli di Molecular and cellular Biology alcune lezioni verranno svolte sotto forma di esercitazioni, aventi per oggetto l'analisi dettagliata di articoli scientifici e l'elaborazione di progetti di ricerca integrati, sviluppato criticamente anche con il supporto dell'intelligenza artificiale e delle principali risorse bioinformatiche. Per i dettagli riguardanti i diversi moduli, si vedano le rispettive sezioni.
Most lectures will be delivered in person. In the Molecular and Cellular Biology modules, some lectures will be conducted as exercises, focusing on the detailed analysis of scientific articles and the development of integrated research projects, critically developed with the support of artificial intelligence and leading bioinformatics resources. For details on the various modules, see the respective sections.- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
I concetti e le nozioni appresi dallo studente saranno verificati per mezzo di una prova scritta per ciascuno dei tre moduli. Il voto finale sarà espresso in trentesimi e deriverà dalla media ponderata (rispetto al numero di CFU) delle valutazioni delle tre prove.
Cell Biology
I concetti e le nozioni appresi dallo studente saranno verificati attraverso un’unica prova scritta, articolata in quattro sezioni corrispondenti ai moduli dell’insegnamento. La prova, il cui voto finale sarà espresso in trentesimi, comprende sei domande a risposta aperta sugli argomenti teorici, integrate da quesiti di tipo applicativo.
Molecular Biology
La verifica scritta riguarderà sia la competenza acquisita sugli argomenti teorici trattati nel corso e sui loro presupposti, sia la capacità di affrontare problemi a carattere applicativo integrando le diverse conoscenze. Il test prevede 31 domande, con 4 risposte, su ciascuna delle quali lo studente dovrà esprimere un giudizio vero/falso (fornendo un totale di 124 risposte). Ad ogni risposta corretta verrà attribuito un punteggio di 0,25 e non sono previste penalizzazioni per le risposte errate. A seguito della comunicazione del voto dello scritto, gli studenti potranno decidere di sostenere una prova orale facoltativa, che potrà determinare variazioni di punteggio in positivo o negativo non superiori a 3 punti.
Basic methods in drug discovery
I concetti e le nozioni appresi saranno verificati per mezzo di un'unica prova scritta in sezioni corrispondenti ai blocchi del programma. Il voto finale sarà espresso in trentesimi. La prova scritta prevede sia domande a risposta aperta sugli argomenti teorici, sia la soluzione di quesiti a carattere applicativo.
The concepts and notions learned by the student will be assessed through a written exam for the Cell Biology and Basic Methods in Drug Discovery modules, and through an oral exam for the Molecular Biology module. The final grade will be expressed out of 30 and will be the weighted average (with respect to the number of credits) of the scores from the three exams. Detailed information is available in the single modules.
Cell Biology
The concepts and knowledge acquired by the student will be assessed through a single written exam, divided into four sections corresponding to the course modules. The exam, graded on a 30-point scale, consists of six open-ended questions on theoretical topics, complemented by applied problem-solving questions.
Molecular Biology
The written test will assess both the student's acquired knowledge of the theoretical topics covered in the course and their underlying assumptions, as well as their ability to address applied problems by integrating their diverse knowledge. The test consists of 31 questions, with 4 answers, for each of which the student will be asked to express a true/false judgment (providing a total of 124 answers). Each correct answer will be awarded a score of 0.25, and there will be no penalty for incorrect answers. Following the communication of the written exam grade, students may decide to take an optional oral exam, which may result in positive or negative score variations of no more than 3 points.
Basic methods in drug discovery
The concepts and the notions learned by the Students will be verified through a single written test, composed of sections corresponding to the blocks of the program. The final score will be given in thirtieths. The written test will comprise both open questions on the theoretical topics of the course and the solution of applied problems.
- Oggetto:
Attività di supporto
Seminari su articoli scientifici presentati dagli studenti, integrati da approfondimenti da parte dei docenti docenti.
Seminars on scientific articles presented by the students, supplemented by insights from the teaching staff.
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
- Libro
- Titolo:
- Molecular Biology of the Cell - 7th edition
- Anno pubblicazione:
- 2022
- Editore:
- WW Norton & Co
- Autore:
- Bruce Alberts, Rebecca Heald, Alexander Johnson, David Morgan, Martin Raff , Keith Roberts , Peter Walter, John Wilson, Tim Hunt
- Obbligatorio:
- No
- Oggetto:
In alternativa al testo consigliato, e per quanto riguarda gli argomenti di Chimica trattati nel modulo di Basic Methods in Drug Discovery, potranno essere usati come riferimento i testi utilizzati nei corsi di Biologia Molecolare e Cellulare degli anni precedenti. Verranno inoltre fornite reviews volte ad illustrare le tecniche più recenti trattate nel corso e la loro integrazione. Infine verranno forniti articoli da riviste scientifiche, su cui verrà basata l’attività seminarial[e.
As an alternative to the recommended text, and as regards the Chemistry topics covered in the Basic Methods in Drug Discovery module, the texts used in the Molecular and Cellular Biology courses of previous years may be used as a reference. Reviews aimed at illustrating the most recent techniques covered in the course and their integration will also be provided. Finally, articles from scientific journals will be provided, on which the seminar activity will be based.
- Oggetto:
Moduli didattici
- Basic methods in drug discovery (Sezione 1) (BIO0174A)
- Basic methods in drug discovery (Sezione 2) (BIO0174A)
- Cellular Biology (Sezione 1) (BIO0174C)
- Cellular Biology (Sezione 2) (BIO0174C)
- Molecular Biology (Sezione 1) (BIO0174B)
- Molecular Biology (Sezione 2) (BIO0174 B)
- Oggetto:








