Vai al contenuto principale
Coronavirus: aggiornamenti per la comunità universitaria / Coronavirus: updates for UniTo Community
Oggetto:
Oggetto:

Cellular Biology (Sezione 2)

Oggetto:

Cellular Biology

Oggetto:

Anno accademico 2021/2022

Codice attività didattica
BIO0174C
Docenti
Prof. Paolo Ettore Porporato (Titolare del corso)
Dott.ssa Deborah Chiabrando (Titolare del corso)
Corso di studio
Laurea Triennale in Biotecnologie
Anno
3° anno
Periodo
Primo semestre
Tipologia
Caratterizzante
Crediti/Valenza
6
SSD attività didattica
BIO/13 - biologia applicata
Erogazione
Tradizionale
Lingua
Inglese
Frequenza
Obbligatoria
Tipologia esame
Scritto ed orale
Tipologia unità didattica
modulo
Corso integrato
INTEGRATED LABORATORY TECNIQUES (BIO0174)
Prerequisiti

La comprensione dei contenuti dell'insegnamento richiede di aver acquisito solide basi relativamente a tutti gli insegnamenti previsti per i primi due anni del Corso di Studi.

To understand the contents of the teaching, Students will need to have acquired a solid basis of all the subjects that characterize the first two years of the Course of Studies.

Oggetto:

Sommario del corso

Oggetto:

Obiettivi formativi

Lo scopo dell'insegnamento sarà di fornire un'ampia a aggiornata panoramica delle più importanti metodiche sperimentali utilizzate nell'ambito della ricerca biotecnologica di base e applicata. In particolare, il primo modulo (Chimica) fornirà le basi teoriche per la comprensione delle tecnologie spettroscopiche (come ad es. la fluorescenza)  e delle loro applicazioni biologiche;  inoltre questo modulo fornirà nozioni teorico pratiche per lo studio delle proteine mediante modellizzazione per omologia. Il Secondo modulo (Biologia Molecolare) fornirà le nozioni teorico/pratiche necessarie alla comprensione delle tecnologie di sequenziamento di seconda generazione, sia per quanto concerne la gererazione dei dati che la loro gestione e interpretazione bioinformatica. Il terzo modulo (Biologia Cellulare) fornirà le nozioni necessarie alla comprensione delle tecnologie cellulari e biochimiche e microscopiche correntemente utilizzate per lo studio della funzione genica e dei principali processi biologici. Un aspetto fondamentale dell'insegnamento sarà di mettere in evidenza come le diverse tecnologie affrontate possono essere integrate per rispondere a complessi quesiti biologici. A questo scopo verranno analizzati diversi casi di studio tratti dalla letteratura scientifica recente.

The aim of the teaching will be to give a deep and up to date overview of the most recent methodologies used within basic and applied biotechnological research. In particular, the first module (Chemistry) will give the theoretical basis necessary to understand the main spectroscopic techniques (ex. fluorescence) and their biological applications; moreover, this module will offer the theoretical/practical notions necessary to study protein structure through homology modeling. The second module (Molecular Biology) will give the theoretical and practical notions necessary to understand the second generation sequencing technologies, regard to both the generation and the bioinformatic interpretation of the data. The third module (Cellular Biology) will give the notions necessary to understand the cellular, biochemical anb microscopy technologies currently used for the study  of gene function and of the principal biological processes.  A fundamental aspect of the course will be to underscore how the treated technologies can be integrated to address complex biological questions. To this aim, different case-studies will be analyzed from the recent literature.

Oggetto:

Risultati dell'apprendimento attesi

Al termine dell'insegnamento, gli Studenti dovranno dimostrare di aver acquisito un'approfondita conoscenza delle basi teoriche su cui si fondano le metodiche sperimentali analizzate durante le lezioni frontali e le esercitazioni. Inoltre dovranno dimostrare di saper scegliere in modo appropriato le tecnologie necessarie alla soluzione di specifici quesiti biologici e di saperele integrare correttamente allo scopo.

 

At the end of the course, Students will need to have acquired a deep knowledge of the theoretical of the experimental methods analyzed during the lessons and the practical sessions. Moreover,  they will need to know how to appropriately  choose the technologies necessary to address specific biological questions, and how to integrate them to reach the aims.

Oggetto:

Programma

3. Biologia Cellulare (Prof.ssa Defilippi e Prof. Porporato)

  • Le colture cellulari.
  •  Espressione di proteine d'interesse in batteri e in cellule eucariote: tecniche di trasfezione.
  •  Analisi delle proteine cellulari in vivo (localizzazione e funzione).
  • Saggi funzionali nella biologia cellulare:
    1. Saggi di proliferazione
    2. Saggi di migrazione
    3. Saggi di invasione
    4. Tumorigenesi in vitro e in vivo
  •  Tecniche per l'analisi delle proteine:
    1. Elettroforesi (SDS-PAGE) e Western blotting.
    2. Tecniche cromatografie.
    3. Saggi di immunoprecipitazione.
    4. Saggi di attività chinasica di recettori di membrana e valutazione delle risposte segnalatorie nella cellula.
    5. Analisi di interazione di proteine cellulari in vitro mediante pull down assay.
    6. Analisi di interazione di proteine cellulari in vivo mediante FRET.
  •  Tecniche microscopiche:
  1. Microscopia a fluorescenza.
  2. Microscopia confocale.
  3. Microscopia time-lapse.
  4. Esempi di utilizzo di modelli animali in microscopia dinamica.

 3. Cellular Biology (Prof. Defilippi and Prof,. Santoro

  • Cell cultures.
  • Expression of proteins of interest in bacteria and in eukaryotic cells: transfection technologies.
  • In vivo analysis of cellular proteins (localization and function).
  • Functional assays in cellular biology:
    1. Proliferation assays.
    2. Migration assays.
    3. Invasion assays.
    4. In vitro and in vivo tumorigenicity assays.
  •  Protein analysis techniques:
    1. Electrophoresis (SDS-PAGE) and Western blotting.
    2. Chromatographic techniques.
    3. Immunoprecipitation assays.
    4. In vitro kinase assays of membrane receptors and evaluation of cell signaling responses.
    5. In vitro analysis of cellular proteins by pull down assays.
    6. In vivo analysis of cellular proteins by FRET.
  •  Microscopy techniques
  1. Fluorescence microscopy.
  2. Confocal microscopy.
  3. Time-lapse microscopy.
  4. Exemples of the use of animal models in dynamic microscopy.

 

Oggetto:

Modalità di insegnamento

I tre quarti delle lezioni verrano svolte in forma frontale.  Un quarto delle lezioni verrà svolta sotto forma di esercitazioni, aventi per oggetto l'esplorazione delle risorse integrative bioinformatiche disponibili in rete ed esercizi mirati alla soluzione di problemi pratici.

Three quarters of the lessons will be given in form of frontal lessons. One quarter of the lessons will consist of practical sessions, aimed at the exploration of the bioinformatic integrative resources available on the web and on problem-solving excercises.

Oggetto:

Modalità di verifica dell'apprendimento

I concetti e le nozioni appresi dallo studente saranno verificati per mezzo di un'unica prova scritta,costituita da quattro sezioni corrispondenti ai quattro moduli dell'insegnamento. Il voto finale sarà espresso in trentesimi. La prova scritta prevede sia domande a risposta aperta sugli argomenti teorici, sia la soluzione di quesiti a carattere applicativo.

The concepts and the notions learned by the Students will be verified through a single written test, composed of four sections corresponding to the four modules of the course. The final score will be ginven in thirtieths. The written test will comprise both open questions on the theoretical topics of the course and the solution of applied problems.

Oggetto:

Attività di supporto

Le esercitazioni sulle risorse bioinformatiche verranno svolte al calcolatore nei laboratori informatici del Centro di Biotecnologie Molecolari.

The bioinformatics practical sessions will take place in the computer rooms of the Molecular Biotechnology Centre

Testi consigliati e bibliografia

Oggetto:

Alberts, Biologia Molecolare della cellula, quinta edizione, Zanichelli

Verranno inoltre forniti articoli e review volti ad illustrare alcune delle tecniche trattate e la loro integrazione

 



Oggetto:

Note

“Le modalità di svolgimento dell'attività didattica potranno subire variazioni in base alle limitazioni imposte dalla crisi sanitaria in corso. In ogni caso è assicurata la modalità a distanza per tutto l'anno accademico”
Registrazione
  • Aperta
    Oggetto:
    Ultimo aggiornamento: 07/07/2021 10:35
    Location: https://biotec.campusnet.unito.it/robots.html
    Non cliccare qui!