- Oggetto:
- Oggetto:
Basic methods in drug discovery (Sezione 1)
- Oggetto:
Basic methods in drug discovery
- Oggetto:
Anno accademico 2023/2024
- Codice attività didattica
- BIO0174A
- Docente
- Giulia Caron (Titolare del corso)
- Corso di studio
- Laurea Triennale in Biotecnologie
- Anno
- 3° anno
- Periodo
- Primo semestre
- Tipologia
- Affine o integrativo
- Crediti/Valenza
- 3
- SSD attività didattica
- CHIM/08 - chimica farmaceutica
- Erogazione
- Tradizionale
- Lingua
- Inglese
- Frequenza
- Obbligatoria
- Tipologia esame
- Scritto
- Tipologia unità didattica
- modulo
- Insegnamento integrato
- INTEGRATED LABORATORY TECNIQUES (BIO0174)
- Prerequisiti
-
La comprensione dei contenuti dell'insegnamento richiede di aver acquisito solide basi relativamente a tutti gli insegnamenti previsti per i primi due anni del Corso di Studi.
To understand the contents of the teaching, Students will need to have acquired a solid basis of all the subjects that characterize the first two years of the Course of Studies.
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Gli obiettivi formativi del modulo di Basic methods in drug discovery consistono nel fornire le basi teoriche necessarie per comprendere e valutare i metodi di determinazione sperimentale di importanti proprietà molecolari largamente utilizzate nel processo di drug discovery e di tecnologie spettroscopiche comunemente utilizzate nei laboratori di ricerca e industriali. Inoltre, questo modulo fornirà nozioni teorico pratiche per lo studio della struttura 3D delle proteine sia mediante l'uso di dati sperimentali sia mediante modellizzazione per omologia.
The Basic Methods in Drug Discovery module aims to provide the theoretical basis needed to understand and evaluate methods of experimental determination of important molecular properties widely used in the drug discovery process and spectroscopic technologies commonly employed in research and industrial laboratories. In addition, this module will provide the theoretical and practical knowledge to study the 3D structure of proteins both through the use of experimental data and through homological modelling.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE
Acquisizione di competenze teoriche relative ad alcuni concetti di base utilizzati nel processo di scoperta dei farmaci e nelle comuni attività di ricerca biotecnologica.
CAPACITC DI APPLICARE CONOSCENZE
Sviluppo della capacità di incorporare informazioni chimiche provenienti da varie fonti e lo studio delle strutture 3D di molecole, piccoli peptidi e proteine, nel lavoro di ricerca quotidiano.
AUTONIMIA DI GIUDIZIO
Valutazione critica delle informazioni ottenute dai dati sperimentali e dall'analisi dei server web.
ABILITÀ COMUNICATIVE
Acquisizione della comunicazione orale e scritta dei risultati e della capacità di utilizzare il linguaggio grafico.
CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO
Acquisizione di capacità di apprendimento autonomo e di autovalutazione della propria preparazione.
KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING
Acquisition of theoretical skills concerning some basic concepts used in the drug discovery process and in the common biotechnological research activities
APPLYING KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING
Development of the ability to incorporate chemical information from various sources and the study of 3D structures of molecules, small peptides and proteins, into daily research work
MAKING JUDGEMENTS
Critical evaluation of the information obtained from experimental data and web server analysis
COMMUNICATION SKILLS
Acquisition of oral and written communication of results as well as the ability to use graphical language
LEARNING SKILLS
Acquisition of autonomous learning capacity and self-assessment of its preparation
- Oggetto:
Programma
Proprietà molecolari di interesse nel drug discovery
- solubilità
- misura del pH e tamponi di interesse fisiologico
- ionizzazione e determinazione della pKa
Spettroscopia UV-Vis e di fluorescenza
- fattori sperimentali che influenzano gli spettri UV-Vis, interpretazione ed applicazione in drug discovery
- nozioni di base di fluorescenza e loro applicazione in analisi strutturali di proteine
Struttura chimica di peptidi e proteine e determinazione sperimentale
- cristallografia ai raggi X a cristallo singolo, PDB
- crio microscopia elettronica
Costruzione in silico della struttura 3D di peptidi e di proteine
- uso di software e di web server per strutture di piccoli peptidi
- homology modelling
- utilizzo di AlphaFold
- nozioni di base per l'utilizzo delle strutture 3D in drug discovery
Molecular properties of interest in drug discovery
- solubility
- pH measurement and buffers of physiological interest
- ionization and pKa determination
UV-Vis and fluorescence spectroscopy
- experimental factors affecting UV-Vis spectra, interpretation and application in drug discovery
- basics of fluorescence and their application in structural analysis of proteins
Chemical structure of peptides and proteins and experimental determination
- single crystal X-ray crystallography, PDB
- cryo electron microscopy
In silico construction of 3D structure of peptides and proteins
- use of software and web servers for small peptide structures
- homology modelling
- use of AlphaFold
- basics of using 3D structures in drug discovery
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
Le lezioni verranno svolte in forma frontale
The lessons will be held in frontal mode
- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
I concetti e le nozioni appresi saranno verificati per mezzo di un'unica prova scritta, costituita da quattro sezioni corrispondenti ai quattro moduli dell'insegnamento. Il voto finale sarà espresso in trentesimi. La prova scritta prevede sia domande a risposta aperta sugli argomenti teorici, sia la soluzione di quesiti a carattere applicativo.
The concepts and the notions learned by the Students will be verified through a single written test, composed of four sections corresponding to the four modules of the course. The final score will be given in thirtieths. The written test will comprise both open questions on the theoretical topics of the course and the solution of applied problems.
- Oggetto:
Attività di supporto
Verranno proposte attività pratiche che si potranno svolgere su qualsiasi notebook
Practical activities will be proposed that can be carried out on any notebook
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Verranno fornite le diapositive usate a lezione, inoltre verranno consigliati articoli su alcune delle tecniche trattate nel corso
Slides used in class will be provided and articles on some of the techniques covered in the course will be recommended
- Registrazione
- Chiusa
- Apertura registrazione
- 01/10/2020 alle ore 00:00
- Chiusura registrazione
- 31/12/2022 alle ore 23:55
- Oggetto:
