- Oggetto:
- Oggetto:
C.I. BIOLOGIA MOLECOLARE E BIOINFORMATICA - Biologia Molecolare
- Oggetto:
Anno accademico 2010/2011
- Codice dell'attività didattica
- INT0204
- Docenti
- Lorenzo Silengo (Titolare del corso)
Ferdinando Di Cunto (Titolare del corso) - Corso di studi
- laurea i^ liv. in biotecnologie - a torino
- Anno
- 2° anno
- Tipologia
- Di base
- Crediti/Valenza
- 6
- SSD dell'attività didattica
- BIO/11 - biologia molecolare
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il modulo di Biologia Molecolare si propone di trasmettere le conoscenze necessarie alla comprensione della struttura e della funzione del materiale genetico, sia nei loro aspetti generali sia nella loro applicazione a problematiche biotecnologiche.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
- Comprensione approfondita della struttura e del funzionamento dei geni procariotici ed eucariotici
- Comprensione delle principali metodiche di analisi molecolare
- Comprensione generale degli strumenti tecnici utilizzati per la manipolazione dell'espressione genica nei diversi organism
- Oggetto:
Programma
Biologia Molecolare
1. Controllo dell'espressione genica
- Controllo dell'espressione genica nei procarioti
- Controllo dell'espressione genica negli eucarioti
- Controllo post-trascrizionale
- Controllo dell'espressione genica e differenziamento cellulare
2. Analisi della struttura dei geni
- Ibridazione degli acidi nucleici
- Enzimi di restrizione e DNA ligasi
- Oligonucleotidi sintetici
- Polymarase Chain Reaction
- Produzione di sonde marcate
- Analisi del DNA mediante Southern blot
- Sequenziamento del DNA; sequenziamento genomico
- Polimorfismi del DNA
3. Il clonaggio dei geni
- Vettori plasmidici e fagici, clonaggio di frammenti di DNA
- Costruzione di library genomiche e di cDNA
- Screening di DNA libraries mediante ibridazione
- Rapid amplification of cDNA ends (RACE)
- Il progetto Genoma Umano e gli altri progetti genoma
4. Analisi dell’espressione genica
- Northern e western blotting
- Reverse-transcription- (RT)-PCR
- Real time PCR
- Ribonuclease protection assay
- Ibridizzazione in situ
- Microarrays
5. Produzione di proteine ricombinanti
- Sistemi di espressione procariotici
- Espressione in lieviti
- Espressione in cellule di mammifero: vettori non virali e virali
- Animali e piante transgenici
- Sistemi di espressione eucariotici inducibili e reprimibili
- Concetti generali sugli organismi geneticamente modificati
- Metodi di mutagenesi
6. Uso di vettori di espressione per il clonaggio funzionale dei geni
- Produzione e strategie screening di cDNA library di espressione in vettori fagici
- Il sistema del doppio ibrido in lievito
- RNA interference
7. Basi molecolari dell’evoluzione
8. Approcci generali all’analisi della funzione genica
Elementi di Bioinformatica
1. Significato dei principali database bioinformatici
- Il sistema Entrez
- Banche dati nucleotidiche
- Banche dati aminoacidiche
2. Deduzione di una sequenza aminoacidica da una sequenza nucleotidica
3. Allineamento di sequenze: concetti generali
4. Conservazione evolutiva delle sequenze
- Concetto di evoluzione divergente: Geni ortologhi e paraloghi
- Conservazione evolutiva di struttura, sequenza aminoacidica e sequenza nucleotidica.
- Ricerca di seqeunze omologhe con iprogrammi BLAST
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Note
- Lezioni: totale 50 ore
- Seminari: totale 8 h - Esercitazioni di laboratorio informatico a piccoli gruppi: 6 ore per gruppo
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