- Oggetto:
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Methods in Computational Biology III
- Oggetto:
Methods in Computational Biology III
- Oggetto:
Anno accademico 2021/2022
- Codice dell'attività didattica
- BIO0221C
- Docente
- Prof. Ugo Ala (Titolare del corso)
- Insegnamento integrato
- METHODS IN COMPUTATIONAL BIOLOGY (BIO0221)
- Corso di studi
- Laurea Triennale in Biotecnologie
- Anno
- 3° anno
- Periodo didattico
- Secondo semestre
- Tipologia
- A scelta dello studente
- Crediti/Valenza
- 2
- SSD dell'attività didattica
- BIO/13 - biologia applicata
- Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Inglese
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Scritto ed orale
- Prerequisiti
- Conoscenze di genetica e di biologia molecolare, in particolare dei meccanismi di regolazione genica.
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il corso si propone di presentare agli studenti una panoramica sugli approcci che sono stati sviluppati nei campi della vita artificiale e dei sistemi complessi. In particolare, il filo conduttore del corso sarà lo studio della network science (reti e alberi) nella modellizzazione di fenomeni biologici, con particolare attenzione alle dinamiche molecolari evolutive e di regolazione genica, al fine di fornire agli studenti una panoramica dei concetti di filogenesi ed evoluzione degli organismi e degli approcci computazionali adatti agli studi di epidemiologia molecolare e della regolazione genica.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Gli studenti acquisiranno la capacità di leggere criticamente lavori scientifici sulla modellizzazione mediante approcci computazionali di fenomeni biologici, che descrivono e analizzano risultati sperimentali high-throughput relativi alla regolazione ed espressione genica, oltre che inferenze di tipo evolutivo nel campo dell'epidemiologia molecolare
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
Gli argomenti del corso verranno affrontati attraverso presentazioni dei docenti e la lettura critica di pubblicazioni scientifiche recenti.
- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
Colloquio orale che consiste nella presentazione di due articoli della letteratura primaria scelti dallo studente e relativi a due diverse parti del corso.
- Oggetto:
Attività di supporto
- Oggetto:
Programma
Regolazione Genica
- I network di regolazione trascrizionale e post-trascrizionale
- Metodi sperimentali high-throughput per lo studio della regolazione genica
- Analisi e interpretazione dei dati sperimentali
- Metodi computazionali per lo studio della regolazione genica
- Network di regolazione genica
Modeling in science and Scientific method
- Scientific method and its evolution
- Experimental design
- Computational modeling in life sciences
- Mathematical models in biotechnology: e.g. ceRNA cross-talk
- Statistical models in epidemiology: e.g. vector borne diseases
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Regolazione Genica
- Articoli indicati durante il corso
- Oggetto:
Note
“Le modalità di svolgimento dell'attività didattica potranno subire variazioni in base alle limitazioni imposte dalla crisi sanitaria in corso. In ogni caso è assicurata la modalità a distanza per tutto l'anno accademico”- Oggetto:
