Corso di Laurea in Biotecnologie

Informatica

Informatics

Anno accademico 2017/2018

• Fisica e Informatica (INT0639)

Sommario insegnamento

• Obiettivi formativi
• Risultati dell'apprendimento attesi
• Modalità di insegnamento
• Modalità di verifica dell'apprendimento
• Attività di supporto
• Programma
• Testi consigliati e bibliografia
• Strumenti didattici

Obiettivi formativi

Il modulo intende fornire agli studenti le conoscenze di base per poter utilizzare un computer, focalizzando l'attenzione sull'utilizzo del sistema operativo Linux. Verranno inoltre presentati dei concetti di base di algoritmica e programmazione.

Risultati dell'apprendimento attesi

I metodi e le tecniche viste durante il corso ed acquisite mediante le esercitazioni svolte nei laboratori informatici forniranno agli studenti non solo gli strumenti utili alla gestione e manipolazione di file di interesse biologico, ma anche la capacità di strutturazione logica nella soluzione di un problema.

Modalità di insegnamento

 Lezioni frontali ed esercitazioni in aula informatica (in gruppi da max 30 studenti)

Modalità di verifica dell'apprendimento

 Prova scritta volta a verificare sia le conoscenze teoriche sia le capacita' pratiche acquisite nel corso

Attività di supporto

I concetti visti a lezione verranno applicati in laboratorio informatico, dove, utilizzando il sistema operativo Linux, i concetti base di algoritmica verranno affrontati mediante la programmazione in Perl, con particolare attenzione alla gestione e manipolazione di file di interesse biologico.

Programma

Dopo una breve introduzione su alcuni concetti di base delle tecnologie dell'informazione (la sua storia, la rappresentazione dei dati, la struttura fisica di un elaboratore elettronico, il software, l'organizzazione logica di dati), verranno presentati il mondo Unix ed il sistema operativo Linux. In particolare verranno affrontati, per tale sistema operativo, argomenti quali manipolazione di file, processi, redirezione, pipe, filtri ed espressioni regolari.

Nella seconda parte del corso i concetti base di algoritmica verranno affrontati mediante la programmazione in Perl. Considerata la natura introduttiva di questo corso, agli studenti verranno presentati i concetti di variabile scalare e di array, oltre all strutture sintattiche di base della programmazione quali istruzioni condizionali e cicli.

• Avalle U, Carmagnola F, Cena F, Console L, Ribaudo M, Introduzione all'informatica, UTET Libreria, 2005
• Jon Lasser, Think Unix, Que, 2000
• James Tisdall, Beginning Perl for Bioinformatics, O'Reilly, 2001
• Cynthia Gibas e Per Jambeck, Developing Bioinformatics Computer Skills, O'Reilly, 2001
• Robbe Wunschiers, Computational Biology: Unix/Linux, Data Processing and Programming, Springer, 2004 

Orario lezioni

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