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C.I. BIOLOGIA MOLECOLARE E COMPUTAZIONALE

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Anno accademico 2007/2008

Codice dell'attività didattica
0005S
Docenti
Lorenzo Silengo (Titolare del corso)
Ferdinando Di Cunto (Titolare del corso)
Paolo Provero (Titolare del corso)
Corso di studi
laurea spec. in biotecnologie molecolari - a torino
Anno
1° anno
Tipologia
Indirizzo Bio-Molecolare
Crediti/Valenza
6+5
Oggetto:

Sommario insegnamento

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Programma

Richiami di probabilità e statistica

Lezione 1: introduzione alla probabilita' - spazi campionari e variabili aleatorie (PP)

Lezione 2: distribuzioni di probabilita'. Distribuzione binomiale e normale (PP)

Lezione 3: Statistica descrittiva. Statistica inferenziale: teoria della stima (PP)

Lezione 4: Test di ipotesi (PP)

Lezione 5: Indipendenza e correlazione. test di correlazione (PP)

Allineamento di sequenze

Lezione 6: Algoritmi di allineamento: Needleman-Wunsch e Smith-Waterman (PP)

Lezione 7: Algoritmi di allineamento euristici: BLAST, sue varianti e suo utilizzo per il ‘data mining’ (FDC)

Lezione 8: Algoritmi di allineamento multiplo: CLUSTALW (FDC)

Lezione 9: Ricerca di motivi funzionali nelle sequenze degli acidi nucleici e delle proteine (FDC)

Lezione 10: Ricostruzione di alberi filogenetici e introduzione al clustering (PP.

Sequenziamento e annotazione di genomi 

Lezione 11: Strategie di sequenziamento (FDC)

Lezione 12: Sequenze EST (FDC)

Lezione 13: Metodi per la predizione di strutture geniche in sequenze genomiche (FDC)

Lezione 14: Browsers genomici (FDC)

Testi consigliati e bibliografia

Oggetto:

G. Valle, Introduzione alla Bioinformatica, Zanichelli


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Note

Sono previste esercitazioni in laboratorio informatico, riguardanti l’utilizzo a scopo di ricerca degli strumenti bioinformatici descritti a lezione, per un totale di 20 ore.
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Ultimo aggiornamento: 22/09/2008 10:14
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